Mugerreko pleita gunea handitzeko xedea adierazi du Euskal Hirigune Elkargoak. Gune horretan ezarriak diren enpresek maniobra ahalmen handiagoa nahi lukete merkantziak trenetik kamioietara kargatzen dituztenean; ondorioz, hamazazpi hektareako eremuan zabaldu nahi lukete egungo azpiegitura. Eremu hori gune hezea da, eta betoinez betetzea gaitzetsi dute CADE eta Mugerreko ingurumenaren aldeko taldeak. CNPN Naturaren Babeserako Kontseilu Nazionalaren ikerketak ere, proiektuaren kontrako iritzia eman du. Bestalde, gune horretan ere medikuntza tresnen salmentan ari den DJO enpresa ezartzea aurreikusia da, nahiz eta tren jarduerarekin zerikusirik ez ukan. Ingurumenaren aldeko elkarteen arabera, enpresa hori urrunago den gatzaga ohian plantatzen ahal litzateke ingurugiroa kaltetu gabe.